转录调控泛指RNA层面各类RNA调控关系,包含常规RNA测序如转录组测序、非编码RNA测序以及RNA修饰组学等。 其中狭义的转录组检测对象为总RNA中的mRNA,而全转录组的检测对象则是转录出来的所有类型RNA 的总和,包括mRNA 和非编码RNA(ncRNA),如miRNA …
最近在写转录组(sc+st)论文,是我的第一篇转录组的论文。有一些问题求教大佬们 1.发现肿瘤子亚群后怎么继续讲故事呢, 2.感觉转录组分析难只通过分… 显示全部
转录组测序获得的序列怎么进行克隆? 要对一个基因进行克隆,转录组数据只有CDS序列,但是看网上的教程还需要这个基因的上下游序列,才能完整克隆CDS序列,这种情况应该怎么办呢?
转录组分析需要具备扎实的生物学基础知识,包括基因结构、表达调控机制、信号传导途径、疾病发生机制等相关知识。 在进行转录组分析前,需要了解样本来源、实验设计、RNA提取、测序、数据质量评估等相关知识,对所研究的问题有一个全面的认识。
单细菌转录组测序技术是一项新兴的高通量测序技术,专注于单个细菌的基因表达分析。 它突破了传统高通量混池测序的限制,不仅揭示了单个细菌的基因表达状态,还揭示了细菌群体内的功能多样性。
2024年1月5日 · 首先对转录组和代谢组分别进行kegg注释和富集分析,然后将代谢的数据与转录组的数据整合到一个通路图上,选择即在代谢层面富集的通路,又在转录层面富集的通路,最终锁定某几个关键通路,挑选关键通路基因进行qPCR验证。 再来说第二类:基于相关性的 ...
对细菌在LB培养基上的生长情况进行评估,并进行转录组比较分析和qRT-PCR验证,以鉴定IolR在嗜水气单胞菌NJ-35中的功能。 结论 本研究证实IolR通过下调嗜水气单胞菌RpmA的表达来抑制细胞的自聚集和生物膜形成,从而进一步减少与钙的接触机会,进而抑制凝集形成 ...
本团队开发了 iSpatial 算法,通过整合空间转录组和单细胞转录组数据集来推导整个转录组的空间模式。 优势:相比于其他的方法,iSpatial 在预测基因表达和空间分布中具有更高的准确性;它减少了原始数据集中的假阳性和假阴性信号。
无参转录组一般没有比对率的标准,比对率6,70算是正常标准了,高的也就80多。 如果觉得低,可以测个全长转录组作为无参样本的参考基因组。 全场转录组测序读长比较长,相对于二代自拼接来说比对率会高一些。
2022年11月14日 · 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 喜报!易基因单细胞DNA甲基化+单细胞转录组测序分析结果见刊《J Anim Sci Biotechnol》 水牛(Bubalus bubalis)是热带和亚热带地区重要的经济动物,但水牛产业的发展受到但其低繁殖力的 …